La organización ha reconocido el esfuerzo por reducir el impacto ambiental y la descarbonización de la actividad portuaria con iniciativas como el uso de combustibles más limpios y la electrificación de los muelles.
La Autoridad Portuaria de Cartagena ha obtenido el premio EMAS de gestión ambiental 2019 en la categoría de organizaciones públicas pequeñas. El galardón fue entregado en la ceremonia celebrada en Bilbao y que contó con una amplia representación del Puerto de Cartagena.